Dat doe je op de volgende manier in je php script:

$document = & JFactory::getDocument();
$document->addScript( 'includes/js/my_javascript.js');

Dan zal joomla een link maken naar dit script:

<script type="text/javascript" src="/includes/js/my_javascript.js"></script>

Pas op:

In het script bestand moet je geen <script> </script> opnemen.
Dit geldt ook voor de css bestanden (zie onder)

Als we dat met een css bestand willen doen gebruiken we:

$document->addStyleSheet('components/com_mycomponent/my_component.css');